Medicamentele împotriva HIV țin virusul HIV sub control dar pot să te afecteze și în alt mod. Orice urmări neașteptate sau nedorite ale luării medicamentelor se numesc efecte secundare. Efectele secundare apar, de obicei, din cauza faptului că ți se obișnuiește corpul cu un nou medicament. După câteva săptămâni, de regulă, aceste efecte secundare dispar.